RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 EPM2AB3EWF7 344 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGEF1-209ENST00000607882 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 LELP1Q5T871 98 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK12Q9UKR0 248 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf90A8MZG2 172 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 PSCAO43653 123 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00158P58513 81 aa8.33□□□□□ -1.08
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2D-28P01615 120 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 C22orf24Q9Y442 160 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 C5orf38Q86SI9 138 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 RYR1P21817 5038 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 ACYP1P07311 99 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WYN8 130 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPG2P98160 4391 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAL4O96015 105 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WTM6 91 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WZ39 114 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.27□□□□□ -1.09
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RABGEF1-209ENST00000607882 XCL1P47992 114 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00643Q86TS7 51 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 IMUPQ9GZP8 106 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 ATOX1O00244 68 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 ENHOQ6UWT2 76 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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RABGEF1-209ENST00000607882 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-1P60331 282 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R378 163 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 SERP2Q8N6R1 65 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 NCR3O14931 201 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-209ENST00000607882 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q8N814 137 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GUV1 79 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 REG3AQ06141 175 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-209ENST00000607882 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MUN3 132 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 CXCL5P42830 114 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00846Q9NV44 126 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-209ENST00000607882 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA0087Q14695 138 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 MYCBP2O75592 4640 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WVE0 104 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MU10 97 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR34Q9NV39 138 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 Q8NDZ9 215 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 RMI2Q96E14 147 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf197Q8N268 126 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6JHZ5 121 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf99Q4VX62 202 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 COX17Q14061 63 aa8.08□□□□□ -1.12
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