RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRLHP81277 87 aa6.37□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.37□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A6NDN8 102 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRYO14603 147 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF861PO60384 105 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFC1BP0CG36 223 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFC1P0CG37 223 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR1AP35321 89 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBE2AP49459 152 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FXYD2P54710 66 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEND1Q8N111 149 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COPS9Q8WXC6 57 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYCBP2O75592 4640 aa6.35□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.34□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.34□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.34□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-216ENST00000607519 B5MCH6 92 aa6.33□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CTAG1AP78358 180 aa6.33□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TAL2Q16559 108 aa6.33□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H7C2G1 150 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERC2-IT1O76042 136 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSD52Q0P140 79 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.32□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H0Y9J4 135 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 K7ERJ3 54 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C6orf99Q4VX62 202 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DIRC1Q969H9 104 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q9BRP9 147 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.3□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNXBP22105 4242 aa6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GHRHP01286 108 aa6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB37Q96AX2 223 aa6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.28□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COX7BP24311 80 aa6.28□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0B4J2C4 111 aa6.27□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q6ZRX8 168 aa6.27□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSTD3H0UI37 97 aa6.26□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.26□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.26□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.26□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1HL1P0DM35 61 aa6.25□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.24□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GWB2 263 aa6.24□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC01600Q96MT4 127 aa6.24□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR4Q96PI1 79 aa6.24□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A087X002 238 aa6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP10-8P60410 259 aa6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.22□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OXTP01178 125 aa6.22□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BATFQ16520 125 aa6.22□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q1RN00 199 aa6.22□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TSPAN13O95857 204 aa6.21□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.21□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.21□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIAP1O43715 76 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00575Q6W349 94 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.19□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 M0R143 59 aa6.19□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VAMP3Q15836 100 aa6.19□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC2BQ92478 149 aa6.18□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 hADV29S1A0JD25 119 aa6.17□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CRYGAP11844 174 aa6.17□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSMB2P49721 201 aa6.17□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LINC00483Q53H64 154 aa6.17□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.16□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.16□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.15□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A20O43772 301 aa6.15□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8N377 158 aa6.15□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H0YGX0 51 aa6.14□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q6ZQY7 126 aa6.14□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMIM29Q86T20 159 aa6.14□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 271.5 ms