RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.35□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 ITPR3Q14573 2671 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 hDV103S1A0JD37 113 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZRP5 223 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 AKAP9Q99996 3911 aa10.34□□□□□ -0.75
PDE4C-211ENST00000597360 ERC2-IT1O76042 136 aa10.33□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.32□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.31□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00208Q96KT6 92 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 M0R378 163 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 MP68P56378 58 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 A0A0J9YWU9 116 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 PRR15LQ9BU68 103 aa10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 A8MU10 97 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 PRR15Q8IV56 129 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.29□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 C1orf137Q5JT78 98 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.28□□□□□ -0.76
PDE4C-211ENST00000597360 A6NED7 52 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 UBE2BP63146 152 aa10.27□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.26□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZRU5 148 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 A0A0G2JQZ4 141 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1W2PNN7 141 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 K7EQZ3 153 aa10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV1-51P01701 117 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 VPREB1P12018 145 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4C-211ENST00000597360 Q1T7F1 81 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 SYCNQ0VAF6 134 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 B9D2Q9BPU9 175 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 Q8N377 158 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 PSCAO43653 123 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 UBE2AP49459 152 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 CD164Q04900 197 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 LELP1Q5T871 98 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 HCG22E2RYF7 251 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 X6R8D5 127 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1W2PNM2 257 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFB1O75438 58 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 LYRM9A8MSI8 78 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 FSHBP01225 129 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4C-211ENST00000597360 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.15□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 A0A096LNI7 61 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 C7orf33Q8WU49 177 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 SMR3AQ99954 134 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 Q8NBF4 154 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 A0A087WSZ3 146 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 H0Y9P7 68 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 DSCR10P59022 87 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 PCOTHQ58A44 107 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4C-211ENST00000597360 Q5VV11 94 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 HIVEP1P15822 2718 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 ATRQ13535 2644 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 H0Y9J4 135 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 C16orf90A8MZG2 172 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 FAM168BA1KXE4 195 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 APOC4P55056 127 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 LIMD2Q9BT23 127 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 PRR34Q9NV39 138 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 CASC2Q6XLA1 102 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFS5O43920 106 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZRX8 168 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 Q9BRP9 147 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 C15orf56Q8N910 161 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 PRLHP81277 87 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4C-211ENST00000597360 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms