RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFC1	P0CG37	223 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0QXV9	152 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576		M0R378	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0B4J2C4	111 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576		C9JAW5	83 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2B	P63146	152 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCL1B	O95988	128 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A20	O43772	301 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNCG	O76070	127 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAT1	Q14517	4588 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX6C	P09669	75 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRY	O14603	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPG2	P98160	4391 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPRR1A	P35321	89 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIAP1	O43715	76 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	RYR1	P21817	5038 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.65	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.64	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6Q795	121 aa		5.64	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.64	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCE1	O60756	84 aa		5.64	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.64	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRLH	P81277	87 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	COX7B	P24311	80 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZRX8	168 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2A	P49459	152 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q9BRP9	147 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0YGX0	51 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.6	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		5.6	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.6	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.59	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0Y9J4	135 aa		5.59	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF861P	O60384	105 aa		5.59	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.59	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.59	□□□□□ -1.51
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.58	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.58	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.58	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.57	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.57	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q5VSD8	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	LST1	O00453	97 aa		5.56	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
EFTUD2-223	ENST00000592576		Q6ZQY7	126 aa		5.55	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.2 ms