RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.05□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.04□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2D-28P01615 120 aa7.04□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 UBE2AP49459 152 aa7.04□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.04□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 A0A0U1RQV1 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 IFITM1P13164 125 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 NPC2P61916 151 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 PRLHP81277 87 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.03□□□□□ -1.28
CTIF-208ENST00000590422 TSTD3H0UI37 97 aa7.02□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.02□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 Q8NDZ9 215 aa7.02□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 HIST1H4GQ99525 98 aa7.02□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.02□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 VPREB1P12018 145 aa7.01□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.01□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.01□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 COPS9Q8WXC6 57 aa7.01□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 TAL2Q16559 108 aa7□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 MUC17Q685J3 4493 aa7□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 NDUFC2O95298 119 aa6.99□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 HSD52Q0P140 79 aa6.99□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 TMEM126AQ9H061 195 aa6.99□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 M0R378 163 aa6.98□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.98□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 TPRXLQ17RH7 258 aa6.97□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.97□□□□□ -1.29
CTIF-208ENST00000590422 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 A4D1N5 150 aa6.96□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 CTAG1AP78358 180 aa6.96□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 CEND1Q8N111 149 aa6.96□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 DDTP30046 118 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 FXYD2P54710 66 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 CDIP1Q9H305 208 aa6.95□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 NCR3O14931 201 aa6.94□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.93□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 IGLV6-57P01721 117 aa6.92□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.92□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.92□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 A6NJY4 79 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 CFC1BP0CG36 223 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 CFC1P0CG37 223 aa6.91□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 M0R143 59 aa6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 SPRR4Q96PI1 79 aa6.9□□□□□ -1.3
CTIF-208ENST00000590422 A0A0B4J2C4 111 aa6.89□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 A6NDN8 102 aa6.89□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GWB2 263 aa6.88□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 SPRR1AP35321 89 aa6.88□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.88□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.87□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 RAB37Q96AX2 223 aa6.87□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 K7ERJ3 54 aa6.86□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 PRYO14603 147 aa6.86□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 Q8NBF4 154 aa6.86□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.86□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.86□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.85□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.85□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.85□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 BATFQ16520 125 aa6.84□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.84□□□□□ -1.31
CTIF-208ENST00000590422 H7C2G1 150 aa6.83□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.83□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.82□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.82□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 C6orf99Q4VX62 202 aa6.81□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.8□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.8□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 LINC00483Q53H64 154 aa6.8□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.8□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 B5MCH6 92 aa6.79□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 ERC2-IT1O76042 136 aa6.79□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 Q1RN00 199 aa6.79□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 COX7BP24311 80 aa6.78□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 MOBPQ13875 183 aa6.78□□□□□ -1.32
CTIF-208ENST00000590422 TRIAP1O43715 76 aa6.77□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 SPINK1P00995 79 aa6.77□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.77□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
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