RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf57	Q99622	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	PRY	O14603	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZVH6	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744		A4D1N5	150 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744		A6NDN8	102 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RPL4-208	ENST00000564744	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF861P	O60384	105 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		H0Y9J4	135 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	SPRR1A	P35321	89 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	CEND1	Q8N111	149 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		B5MCH6	92 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		H7C2G1	150 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	FXYD2	P54710	66 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	MYCBP2	O75592	4640 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	HSD52	Q0P140	79 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	TAL2	Q16559	108 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	CFC1	P0CG37	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	COX7B	P24311	80 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZRX8	168 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		Q9BRP9	147 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744		K7ERJ3	54 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL4-208	ENST00000564744	OXT	P01178	125 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	CTAG1A	P78358	180 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0B4J2C4	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		A6NJY4	79 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	TSTD3	H0UI37	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		Q1RN00	199 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	TNXB	P22105	4242 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087X002	238 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1B0GWB2	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	CRYGA	P11844	174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	VAMP3	Q15836	100 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	BATF	Q16520	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL4-208	ENST00000564744		M0R143	59 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL4-208	ENST00000564744	TSPAN13	O95857	204 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL4-208	ENST00000564744	TRIAP1	O43715	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL4-208	ENST00000564744	PSMB2	P49721	201 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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