RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555370.5

IFT43-210, Transcript of intraflagellar transport 43, humanhuman

TSL 3

Gene IFT43, Length 460 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43-210ENST00000555370 CHTF8P0CG12 524 aa7.38□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 C7orf33Q8WU49 177 aa7.38□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.38□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.38□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.37□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.37□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.36□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 C22orf24Q9Y442 160 aa7.36□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 GAGE10A6NGK3 116 aa7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 M0QXV9 152 aa7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP10-2P60368 255 aa7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 A0A1W2PNN7 141 aa7.34□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 TCL1BO95988 128 aa7.34□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 LINC00167Q96N53 147 aa7.34□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
IFT43-210ENST00000555370 H0YGX0 51 aa7.33□□□□□ -1.24
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IFT43-210ENST00000555370 PRYO14603 147 aa7.33□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 C6orf99Q4VX62 202 aa7.33□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 CLEC2BQ92478 149 aa7.33□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 DIRC1Q969H9 104 aa7.33□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 UBE2V1Q13404 147 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 ATXN8Q156A1 80 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.32□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 LST1O00453 97 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 DPH3Q96FX2 82 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.31□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.3□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 A0A087WYN8 130 aa7.29□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 H3BMG7 143 aa7.29□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 COX7BP24311 80 aa7.29□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.29□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 TRACP01848 142 aa7.28□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 UBE2BP63146 152 aa7.28□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.28□□□□□ -1.24
IFT43-210ENST00000555370 SPRR1AP35321 89 aa7.27□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 REG3GQ6UW15 175 aa7.27□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.26□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 A0A1B0GX51 115 aa7.26□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP10-1P60331 282 aa7.26□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 Q5VSD8 79 aa7.26□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 LINC00575Q6W349 94 aa7.26□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 C9JAW5 83 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 SNCGO76070 127 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 Q6ZSA8 131 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 PRO0461Q9UI25 63 aa7.25□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 DNAL4O96015 105 aa7.24□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 B5MCH6 92 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 F8W1H4 67 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 SLC25A20O43772 301 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 Q6ZRX8 168 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 MTURNQ8N3F0 131 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.23□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 hADV29S1A0JD25 119 aa7.22□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 H3BT86 120 aa7.22□□□□□ -1.25
IFT43-210ENST00000555370 MUC2Q02817 5179 aa7.21□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 SCXQ7RTU7 201 aa7.21□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.21□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.21□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.2□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.19□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 LINC01600Q96MT4 127 aa7.19□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.19□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 FAT1Q14517 4588 aa7.18□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 BCE1O60756 84 aa7.18□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.18□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 Q9BRP9 147 aa7.18□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 H0Y9J4 135 aa7.17□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 UBE2AP49459 152 aa7.17□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 PRLHP81277 87 aa7.17□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 Q6ZQY7 126 aa7.17□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.16□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.16□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.16□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 H3BQ85 93 aa7.15□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 GHRHP01286 108 aa7.15□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 HAMPP81172 84 aa7.15□□□□□ -1.26
IFT43-210ENST00000555370 C1orf137Q5JT78 98 aa7.14□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.14□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 TEN1Q86WV5 123 aa7.14□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.14□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.13□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 ETDBQ3ZM63 59 aa7.13□□□□□ -1.27
IFT43-210ENST00000555370 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.13□□□□□ -1.27
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