RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-230ENST00000551968 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-230ENST00000551968 C11orf86A6NJI1 115 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 HBDP02042 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 YPEL4Q96NS1 127 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 NDUFA6P56556 154 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 DDTP30046 118 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 KRTAP10-10P60014 251 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 SFTA2Q6UW10 78 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 A0A0G2JQZ4 141 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 SPRR1BP22528 89 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 PMCHL1Q16048 86 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 BAGE3Q86Y29 109 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 S100A12P80511 92 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-230ENST00000551968 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 C20orf202A1L168 122 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 SMIM29Q86T20 159 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 LINC00846Q9NV44 126 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 CD164Q04900 197 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 Q5XG85 94 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 TMEM223A0PJW6 202 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 Q1RN00 199 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-230ENST00000551968 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 C5orf52A6NGY3 159 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 HSBP1O75506 76 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 TRGC2P03986 189 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 PRO1933Q9H354 126 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 LINC00310P59036 64 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 Q75L30 129 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 HERV-K104P63124 156 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 COLCA2A8K830 154 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 SERF1AO75920 110 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 LEPROTL1O95214 131 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 LINC00587B1AMM8 73 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-230ENST00000551968 PLNP26678 52 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 S100A6P06703 90 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 AKR1D1P51857 326 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 LEPROTO15243 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 PCP2Q8IVA1 136 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 DPM2O94777 84 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 NDUFC2O95298 119 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 NPC2P61916 151 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 TAL2Q16559 108 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 J3QQQ9 107 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 FABP4P15090 132 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 NMUP48645 174 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-230ENST00000551968 H0Y8G0 127 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 IGKCP01834 107 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HERVK_113P61574 105 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 MDN1Q9NU22 5596 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BKO60814 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 TCL1BO95988 128 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BJP06899 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 FAM236CP0DP71 79 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BOP23527 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BBP33778 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BDP58876 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BCP62807 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 E9PLD3 99 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-230ENST00000551968 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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