RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 TNP2Q05952 138 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087X002 238 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 SZT2Q5T011 3432 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-210ENST00000551525 RTL8CO15255 209 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 PRR9Q5T870 116 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 C22orf24Q9Y442 160 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.25□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 C5orf42Q9H799 3197 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 CRIPTQ9P021 101 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRB-210ENST00000551525 EYSQ5T1H1 3165 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRB-210ENST00000551525 A8MTW9 85 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV7-43P04211 117 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 A8MWP4 228 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 COL6A3P12111 3177 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 VCANP13611 3396 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF575Q86XF7 245 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00167Q96N53 147 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 ROMO1P60602 79 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 APLNQ9ULZ1 77 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 Q8NBF4 154 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-3P60369 221 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRB-210ENST00000551525 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WSZ3 146 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRB-210ENST00000551525 K7EQZ3 153 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRB-210ENST00000551525 Q5VSD8 79 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK1P00995 79 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF292O60281 2723 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-210ENST00000551525 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 PRR34Q9NV39 138 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-210ENST00000551525 MAST4O15021 2626 aa4.08□□□□□ -1.76
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