RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 VAMP3Q15836 100 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 RYR3Q15413 4870 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 COX6CP09669 75 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 Q8NDZ9 215 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-220ENST00000550700 GAGE10A6NGK3 116 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 SNCGO76070 127 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 Q1RN00 199 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 REG3GQ6UW15 175 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 BATFQ16520 125 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 DIRC1Q969H9 104 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 H0Y9J4 135 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 H0YGX0 51 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 SPRR1AP35321 89 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 XGP55808 180 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 BCE1O60756 84 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 PSMB2P49721 201 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 H7C2G1 150 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 K7ERJ3 54 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 SLC25A20O43772 301 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 COX7BP24311 80 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 C6orf99Q4VX62 202 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GX51 115 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 TSPAN13O95857 204 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 UBE2AP49459 152 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 C1orf137Q5JT78 98 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 Q6ZRX8 168 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 C9orf118A6NHY6 69 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 B5MCH6 92 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 ZNF861PO60384 105 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 IGLV7-43P04211 117 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 H3BQ85 93 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 TAX1BP3O14907 124 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 TRIAP1O43715 76 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 H3BUT2 72 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 FABP2P12104 132 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 HAMPP81172 84 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 LINC00575Q6W349 94 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 PKHD1P08F94 4074 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 hADV29S1A0JD25 119 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 Q8N1X5 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPM0 123 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 DNAL4O96015 105 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 TRACP01848 142 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 ATXN8Q156A1 80 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 PRLHP81277 87 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 LST1O00453 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 Q5VSD8 79 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 Q9BRP9 147 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 TCL1BO95988 128 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 CLEC2BQ92478 149 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.6 ms