RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 H0Y9J4 135 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 CCDC179H3BU77 68 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 LEPROTO15243 131 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 VCYO14598 125 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 SS18Q15532 418 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 A0A087WZ39 114 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 J3QQQ9 107 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 C2orf82Q6UX34 121 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00643Q86TS7 51 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 KIR2DL4Q99706 377 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0J9YXY3 114 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 MALP21145 153 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 TIMM17BO60830 172 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 Q1RN00 199 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 A4D1N5 150 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 IGIPA6NJ69 53 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 I3L3M4 83 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 ATOX1O00244 68 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 COX7A2LO14548 114 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 LST1O00453 97 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 CRYGAP11844 174 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 DAND5Q8N907 189 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 C2orf48Q96LS8 159 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM223A0PJW6 202 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 FAM168BA1KXE4 195 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 AMELXQ99217 191 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 COX7CP15954 63 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM258P61165 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TSHBP01222 138 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 SPAG11BQ08648 103 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 C5orf38Q86SI9 138 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TRACP01848 142 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 UBE2BP63146 152 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 TRIAP1O43715 76 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 HERVK_113P63121 156 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-205ENST00000547715 SFTA2Q6UW10 78 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 NDUFA1O15239 70 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 GHRHP01286 108 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 BCE1O60756 84 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 C10orf25Q5T742 122 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 F8WDY8 70 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF861PO60384 105 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-205ENST00000547715 A0A087X002 238 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 H7C2G1 150 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 SERP2Q8N6R1 65 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 MUC17Q685J3 4493 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 NDUFC2O95298 119 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 Q6JHZ5 121 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 LITAFQ99732 161 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 PRSS2P07478 247 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-205ENST00000547715 TPRXLQ17RH7 258 aa8.47□□□□□ -1.05
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