RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.11□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.11□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.11□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.1□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.1□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 REG3AQ06141 175 aa6.1□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 COX17Q14061 63 aa6.1□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.09□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 IGLV6-57P01721 117 aa6.09□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.09□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.09□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 SPAG11BQ08648 103 aa6.09□□□□□ -1.43
THBS3-211ENST00000541990 CXCL6P80162 114 aa6.08□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 NREPQ16612 68 aa6.07□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 BPY2O14599 106 aa6.07□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.07□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 MIFP14174 115 aa6.06□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.06□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 PRO0255Q9UI72 69 aa6.06□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 NDUFC1O43677 76 aa6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 DIRC1Q969H9 104 aa6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.05□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.04□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 A0A0U1RQV1 116 aa6.04□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 BRK1Q8WUW1 75 aa6.04□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 LYRM9A8MSI8 78 aa6.03□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 KLK12Q9UKR0 248 aa6.03□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 IGKV4-1P06312 121 aa6.03□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.03□□□□□ -1.44
THBS3-211ENST00000541990 C3orf84H3BNL1 204 aa6.02□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 COX7BP24311 80 aa6.02□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.02□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.02□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 PDE6GP18545 87 aa6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 OCR1Q9BZK8 76 aa6.01□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 SEC61GP60059 68 aa6□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 C1orf195Q5TG92 126 aa6□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 V9GYY9 64 aa6□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 PRYO14603 147 aa5.99□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 VPREB1P12018 145 aa5.99□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.98□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 ESRGQ1W209 222 aa5.98□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 ERC2-IT1O76042 136 aa5.97□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.97□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.97□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.97□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.97□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.45
THBS3-211ENST00000541990 SMIM29Q86T20 159 aa5.96□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 PRR34Q9NV39 138 aa5.96□□□□□ -1.46
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THBS3-211ENST00000541990 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.95□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZRU5 148 aa5.95□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.95□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 LELP1Q5T871 98 aa5.94□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 H3BQ85 93 aa5.93□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZRP5 223 aa5.92□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 Q8N377 158 aa5.92□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 M0R378 163 aa5.92□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 PRR4Q16378 134 aa5.92□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 KMT2AQ03164 3969 aa5.91□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 C15orf56Q8N910 161 aa5.91□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PNM2 257 aa5.91□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.91□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.91□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.9□□□□□ -1.46
THBS3-211ENST00000541990 CASC10Q5T4H9 136 aa5.9□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 PRR15Q8IV56 129 aa5.9□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.89□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 B9D2Q9BPU9 175 aa5.89□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JQZ4 141 aa5.89□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PNN7 141 aa5.89□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 hDV103S1A0JD37 113 aa5.89□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.88□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 K7EQZ3 153 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 PSPHP1O15172 72 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 C7orf33Q8WU49 177 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 DSCR10P59022 87 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 Q9BRP9 147 aa5.87□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.86□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 FAM168BA1KXE4 195 aa5.86□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.86□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 A8MU10 97 aa5.86□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 PMAIP1Q13794 54 aa5.85□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
THBS3-211ENST00000541990 LCE6AA0A183 80 aa5.85□□□□□ -1.47
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