RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120		C9JAW5	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDB1-208	ENST00000537120	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDB1-208	ENST00000537120		A0A096LNJ9	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDB1-208	ENST00000537120	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDB1-208	ENST00000537120	PRLH	P81277	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120		A0A087X002	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120		M0R378	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	LPA	P08519	4548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDB1-208	ENST00000537120	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	NCR3	O14931	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	TRGC2	P03986	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	HERVK_113	P61574	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		Q8NDZ9	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		A0A0U1RQV1	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		A6NDN8	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		K7EP34	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	PRY	O14603	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	LEPROT	O15243	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		A0A0A0MQY5	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	SERF1A	O75920	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	DPM2	O94777	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFC2	O95298	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	PLN	P26678	52 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		Q6ZVH6	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		J3QQQ9	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	DAND5	Q8N907	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	IGKC	P01834	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		Q5XG85	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	NMU	P48645	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120		Q6Q795	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DDB1-208	ENST00000537120	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	IFITM1	P13164	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	NPC2	P61916	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120		Q8NBF4	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DDB1-208	ENST00000537120	SPRR1A	P35321	89 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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