RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 B5MCH6 92 aa7.45□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.45□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.44□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.44□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZRX8 168 aa7.44□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.44□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 C5orf52A6NGY3 159 aa7.43□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 NPC2P61916 151 aa7.43□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZVH6 145 aa7.43□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 S100A2P29034 98 aa7.42□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.42□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 S100A6P06703 90 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 IFITM1P13164 125 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 LITAFQ99732 161 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.41□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 LINC00483Q53H64 154 aa7.4□□□□□ -1.22
PACS1-210ENST00000529795 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.39□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.39□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.39□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.39□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.38□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.38□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 SPINK1P00995 79 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 Q9BRP9 147 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 ERC2-IT1O76042 136 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 ATOH7Q8N100 152 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 Q8NBF4 154 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-210ENST00000529795 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 COX7BP24311 80 aa7.33□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.32□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.32□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 MOBPQ13875 183 aa7.32□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 TPRXLQ17RH7 258 aa7.32□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 A4D1N5 150 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 A6NDN8 102 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 C6orf99Q4VX62 202 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 PCP2Q8IVA1 136 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.31□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 CDIP1Q9H305 208 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.3□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 RNF213Q63HN8 5207 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GWB2 263 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 SPRR1BP22528 89 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 LPAP08519 4548 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 SCGB1D1O95968 90 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 VAMP3Q15836 100 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 TAL2Q16559 108 aa7.28□□□□□ -1.24
PACS1-210ENST00000529795 A0A0U1RQV1 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 SLC25A20O43772 301 aa7.27□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.26□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.26□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 LIMD2Q9BT23 127 aa7.24□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 Q8N377 158 aa7.22□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 PRO1933Q9H354 126 aa7.22□□□□□ -1.25
PACS1-210ENST00000529795 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.21□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.21□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 HIST1H4GQ99525 98 aa7.21□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 DLEU1O43261 78 aa7.2□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 COX8AP10176 69 aa7.2□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 CD164Q04900 197 aa7.2□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.19□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 SNCGO76070 127 aa7.18□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 Q1RN00 199 aa7.18□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.18□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 H7C2G1 150 aa7.17□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 F8WEM9 126 aa7.16□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.16□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 hADV29S1A0JD25 119 aa7.15□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 VAMP8Q9BV40 100 aa7.15□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 HIGD1BQ9P298 99 aa7.15□□□□□ -1.26
PACS1-210ENST00000529795 SPATA45Q537H7 98 aa7.14□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 LINC00575Q6W349 94 aa7.14□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.13□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 RAB37Q96AX2 223 aa7.13□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 Q5XG85 94 aa7.12□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 SMIM29Q86T20 159 aa7.12□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.12□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 C14orf144Q96I85 54 aa7.12□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.12□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.11□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 A6NJY4 79 aa7.11□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 GHRHP01286 108 aa7.11□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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