RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522466.1

PDGFRB-210, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 296 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-210ENST00000522466 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.13□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC01546A6NGU7 62 aa4.12□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 SFTA2Q6UW10 78 aa4.12□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A0G2JQZ4 141 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC01549A6NIU2 74 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1FP04733 61 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 PMCHL1Q16048 86 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 BAGE3Q86Y29 109 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.11□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A096LNJ9 63 aa4.1□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 MT-ND4LP03901 98 aa4.1□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 Q1RN00 199 aa4.1□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.1□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 TMEM223A0PJW6 202 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP10-10P60014 251 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.09□□□□□ -1.75
PDGFRB-210ENST00000522466 C20orf202A1L168 122 aa4.08□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 SMIM29Q86T20 159 aa4.08□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.08□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.07□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 SPRR1BP22528 89 aa4.07□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.07□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00846Q9NV44 126 aa4.07□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 HBDP02042 147 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 NPC2P61916 151 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 HERV-K104P63124 156 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 CD164Q04900 197 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 PCP2Q8IVA1 136 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 PRO1933Q9H354 126 aa4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.05□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 TAL2Q16559 108 aa4.05□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.05□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.05□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 NEBP20929 6669 aa4.05□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 C5orf52A6NGY3 159 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00587B1AMM8 73 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 NDUFA5Q16718 116 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.04□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 S100A1P23297 94 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 AKR1D1P51857 326 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 Q5XG85 94 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.03□□□□□ -1.76
PDGFRB-210ENST00000522466 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00614P0C842 121 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 FAM236CP0DP71 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 Q75L30 129 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.02□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 NDUFC2O95298 119 aa4.01□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 COMMD7Q86VX2 200 aa4.01□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.01□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.01□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.01□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 TCL1BO95988 128 aa4□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 SEC11CQ9BY50 192 aa4□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 H0Y8G0 127 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 COX7BP24311 80 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 Q96NJ1 140 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.99□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 LEPROTO15243 131 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 S100PP25815 95 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 RHEBQ15382 184 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.98□□□□□ -1.77
PDGFRB-210ENST00000522466 J3QQQ9 107 aa3.96□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 C6orf99Q4VX62 202 aa3.96□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 COX19Q49B96 90 aa3.95□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.95□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.95□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A0J9YXY3 114 aa3.93□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 IFITM2Q01629 132 aa3.93□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 IGFL1Q6UW32 110 aa3.93□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 NMUP48645 174 aa3.92□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.92□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 A8MUU9 505 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.91□□□□□ -1.78
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