RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRU5 148 aa6.82□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRP5 223 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 Q8NAQ8 132 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 PSPHP1O15172 72 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZQY7 126 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 CELA1Q9UNI1 258 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 LY6G6CO95867 125 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 OCR1Q9BZK8 76 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-211ENST00000520276 hDV103S1A0JD37 113 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf84H3BNL1 204 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 ERC2-IT1O76042 136 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV4-1P06312 121 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 PSCAO43653 123 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf25Q5T742 122 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 Q8IZM0 81 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 Q1T7F1 81 aa6.74□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 CD164Q04900 197 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 PRR4Q16378 134 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 PDE6GP18545 87 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-211ENST00000520276 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 KLK12Q9UKR0 248 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 A8MUN3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM29Q86T20 159 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 VWFP04275 2813 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV6-57P01721 117 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 SYCNQ0VAF6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 COX7BP24311 80 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 COX17Q14061 63 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 H3BNG1 76 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 LELP1Q5T871 98 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-211ENST00000520276 CASC10Q5T4H9 136 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 DIRC1Q969H9 104 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 Q5VV11 94 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 LCE6AA0A183 80 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf90A8MZG2 172 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 APLNQ9ULZ1 77 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GUV1 79 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-211ENST00000520276 H3BQ85 93 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 SPAG11BQ08648 103 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 REG3AQ06141 175 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2BP63146 152 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.57□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.56□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 LCA10Q71F78 164 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 FBN3Q75N90 2809 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 HCG22E2RYF7 251 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 C14orf177Q52M58 125 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 K7EQZ3 153 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.54□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 PRR15LQ9BU68 103 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 DSCR10P59022 87 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2AP49459 152 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PNM2 257 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N377 158 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 TGP01266 2768 aa6.51□□□□□ -1.37
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