RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 PDE6GP18545 87 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2BP63146 152 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WVE0 104 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 APLNQ9ULZ1 77 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-208ENST00000510829 DPH3Q96FX2 82 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R2N4 97 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 ANK2Q01484 3957 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 PRYO14603 147 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 C14orf177Q52M58 125 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 NUPR2A6NF83 97 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A096LNI7 61 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZRX8 168 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 ATOX1O00244 68 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZVQ6 151 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-208ENST00000510829 REG3GQ6UW15 175 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 SCXQ7RTU7 201 aa7.09□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 TENM2Q9NT68 2774 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf90A8MZG2 172 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 CHTF8P0CG12 524 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N377 158 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 C3orf84H3BNL1 204 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 Q9BRP9 147 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 NREPQ16612 68 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PNN7 141 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 PRLHP81277 87 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 F8WEM9 126 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 UQCRQO14949 82 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 ERC2-IT1O76042 136 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 COL7A1Q02388 2944 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 COX7CP15954 63 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR1AP35321 89 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf137Q5JT78 98 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 SERP2Q8N6R1 65 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf163Q8N9P6 203 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2AP49459 152 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 BPY2O14599 106 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 CXCL6P80162 114 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N9L7 120 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0G2JQZ4 141 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PNM2 257 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 EPM2AB3EWF7 344 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8NBF4 154 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 LY6G6CO95867 125 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf197Q8N268 126 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WTM6 91 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 PANO1I0J062 215 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 CRYGAP11844 174 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 TNP2Q05952 138 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM29Q86T20 159 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-208ENST00000510829 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 RTL8CO15255 209 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 IGFL1Q6UW32 110 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GW54 56 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WSZ3 146 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 BCE1O60756 84 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV4-1P06312 121 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 SPRR4Q96PI1 79 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 SNURFQ9Y675 71 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-208ENST00000510829 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.85□□□□□ -1.31
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