RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		-0.83	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	PP6455	Q8WZ26	134 aa		-0.83	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	-0.83	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		-0.83	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	APOC2	P02655	101 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	ASIP	P42127	132 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	LZIC	Q8WZA0	190 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	PFDN5	Q99471	154 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABCC5	O15440	1437 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	-0.85	□□□□□ -2.54
ARRDC3-204	ENST00000507075	MYH4	Q9Y623	1939 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MT1E	P04732	61 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	WIZ	O95785	1651 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LTN1	O94822	1766 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MGA	Q8IWI9	3026 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM25A	B3EWG3	89 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM25C	B3EWG5	89 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM25G	B3EWG6	89 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM262	E9PQX1	116 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	GNG7	O60262	68 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MT1G	P13640	62 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	PSMG4	Q5JS54	123 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MT1L	Q93083	61 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	VAMP8	Q9BV40	100 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	AP4S1	Q9Y587	144 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRBA	P50851	2863 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DEPDC5	O75140	1603 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NWD1	Q149M9	1564 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	COX7B	P24311	80 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MYOM2	P54296	1465 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEP290	O15078	2479 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NAIP	Q13075	1403 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGLC2	P0DOY2	106 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGLC3	P0DOY3	106 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC00158	P58513	81 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DEFB106A	Q8N104	65 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CGREF1	Q99674	301 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRO3102	Q9H379	93 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABCC2	Q92887	1545 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	hADV29S1	A0JD25	119 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	C3orf79	P0CE67	100 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	SELENOW	P63302	87 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	PMCHL1	Q16048	86 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MT1M	Q8N339	61 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	LY75	O60449	1722 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	MT2A	P02795	61 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	AKAIN1	P0CW23	69 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
ARRDC3-204	ENST00000507075	DEFB130B	P0DP73	79 aa		-0.9	□□□□□ -2.55

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