RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H4GQ99525 98 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM126AQ9H061 195 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 DLEU1O43261 78 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 PRYO14603 147 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 DIRC1Q969H9 104 aa8.2□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NDN8 102 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 PRLHP81277 87 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE3BQ5TA77 95 aa8.19□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.18□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF861PO60384 105 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.17□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV6-57P01721 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM6P0DI80 62 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 C12orf57Q99622 126 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.16□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 A4D1N5 150 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 H0Y9J4 135 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 HIGD1BQ9P298 99 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.15□□□□□ -1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.14□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.13□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.13□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 PRO1933Q9H354 126 aa8.13□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRR1AP35321 89 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 TAL2Q16559 108 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB37Q96AX2 223 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 B5MCH6 92 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 H7C2G1 150 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 OXTP01178 125 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 C6orf99Q4VX62 202 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 CEND1Q8N111 149 aa8.09□□□□□ -1.11
PGGT1B-204ENST00000503638 HSD52Q0P140 79 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZRX8 168 aa8.08□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 COX7BP24311 80 aa8.07□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 TSTD3H0UI37 97 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 Q1RN00 199 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.05□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 CFC1BP0CG36 223 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 CFC1P0CG37 223 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 FXYD2P54710 66 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 VAMP3Q15836 100 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01600Q96MT4 127 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 Q9BRP9 147 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0B4J2C4 111 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GWB2 263 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BS24 57 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ERC2-IT1O76042 136 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYGAP11844 174 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.01□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 K7ERJ3 54 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A20O43772 301 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CTAG1AP78358 180 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRR4Q96PI1 79 aa8□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R143 59 aa7.98□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMB2P49721 201 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.97□□□□□ -1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087X002 238 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 MT1HL1P0DM35 61 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.96□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 BATFQ16520 125 aa7.94□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 SNCGO76070 127 aa7.93□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-8P60410 259 aa7.93□□□□□ -1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 hADV29S1A0JD25 119 aa7.92□□□□□ -1.14
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