RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.48□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 COL4A6Q14031 1691 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 CHD1O14646 1710 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 CORTO00230 105 aa-0.49□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 S100A1P23297 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.49□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 SNCAP37840 140 aa-0.5□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 C12orf57Q99622 126 aa-0.5□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.5□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.51□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 SEC11AP67812 179 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.51□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.51□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 PZPP20742 1482 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 MT1MQ8N339 61 aa-0.53□□□□□ -2.49
RBM39-242ENST00000498280 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.53□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 ABCA3Q99758 1704 aa-0.53□□□□□ -2.49
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RBM39-242ENST00000498280 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.61□□□□□ -2.51
RBM39-242ENST00000498280 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.61□□□□□ -2.51
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RBM39-242ENST00000498280 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.61□□□□□ -2.51
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RBM39-242ENST00000498280 CUX1P39880 1505 aa-0.62□□□□□ -2.51
RBM39-242ENST00000498280 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RBM39-242ENST00000498280 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RBM39-242ENST00000498280 PMCHL1Q16048 86 aa-0.62□□□□□ -2.51
RBM39-242ENST00000498280 TJP1Q07157 1748 aa-0.62□□□□□ -2.51
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