RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	SPRR1A	P35321	89 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024		A0A087X002	238 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	IFITM1	P13164	125 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CALD1-223	ENST00000496024		B5MCH6	92 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	CRYGA	P11844	174 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZVH6	145 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024		A6NDN8	102 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	COX8A	P10176	69 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZRX8	168 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024		Q9BRP9	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	TSPAN13	O95857	204 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CALD1-223	ENST00000496024		A4D1N5	150 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	COX7B	P24311	80 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	DLEU1	O43261	78 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf57	Q99622	126 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	MOBP	Q13875	183 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GWB2	263 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		H7C2G1	150 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	PRR4	Q16378	134 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		Q8NBF4	154 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	LRP2	P98164	4655 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	TAL2	Q16559	108 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	CFC1	P0CG37	223 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	VAMP3	Q15836	100 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	CEND1	Q8N111	149 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A20	O43772	301 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	FXYD2	P54710	66 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		Q1RN00	199 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	LPA	P08519	4548 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		A6NJY4	79 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	SPRR1B	P22528	89 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	HSD52	Q0P140	79 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CALD1-223	ENST00000496024		A0A0B4J2C4	111 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	SPINK1	P00995	79 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CALD1-223	ENST00000496024	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.62	□□□□□ -1.51

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