RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.59□□□□□ -1.83
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00587B1AMM8 73 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 COX19Q49B96 90 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 UQCC3Q6UW78 93 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 FA2HQ7L5A8 372 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 COMMD7Q86VX2 200 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRR4Q96PI1 79 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.58□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf86A6NJI1 115 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00614P0C842 121 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRR1AP35321 89 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC11CQ9BY50 192 aa3.57□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP5-9P26371 169 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 AKR1D1P51857 326 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SFTA2Q6UW10 78 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 HBDP02042 147 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFA6P56556 154 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00483Q53H64 154 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 BAGE3Q86Y29 109 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.55□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM223A0PJW6 202 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SPINK1P00995 79 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00158P58513 81 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 PMCHL1Q16048 86 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 DAND5Q8N907 189 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM13P0DJ93 91 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 RHEBQ15382 184 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.53□□□□□ -1.84
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0U1RRA0 63 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 ERC2-IT1O76042 136 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.52□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 HERV-K104P63124 156 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.51□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 NCR3O14931 201 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 YPEL4Q96NS1 127 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 Q9BRP9 147 aa3.5□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A20O43772 301 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.49□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GV90 55 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 C5orf52A6NGY3 159 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLV6-57P01721 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 MOBPQ13875 183 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZRX8 168 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 SVBPQ8N300 66 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 C14orf144Q96I85 54 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.48□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MU10 97 aa3.47□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 TSTD3H0UI37 97 aa3.47□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 LEPROTO15243 131 aa3.47□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 DDTP30046 118 aa3.47□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.47□□□□□ -1.85
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFC2O95298 119 aa3.46□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 APOC3P02656 99 aa3.46□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP12-2P59991 146 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 MT1HP80294 61 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 J3QQQ9 107 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 SPRR1BP22528 89 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 NMUP48645 174 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.43□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 DLEU1O43261 78 aa3.43□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PRPF40A-210ENST00000489741 HSBP1O75506 76 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 262.2 ms