RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFC1O43677 76 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 M0R378 163 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 SMR3AQ99954 134 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 PDZD2O15018 2839 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 OCR1Q9BZK8 76 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 PRYO14603 147 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 C15orf56Q8N910 161 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 HIVEP1P15822 2718 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZRP5 223 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 ITPR2Q14571 2701 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 ERC2-IT1O76042 136 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.71□□□□□ -1.33
VWA3B-217ENST00000489630 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.71□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 TENM4Q6N022 2769 aa6.71□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 Q8N377 158 aa6.7□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.69□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.69□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 SMIM29Q86T20 159 aa6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZTC4 211 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 C7orf33Q8WU49 177 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.67□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PNM2 257 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 C8orf87E5RJ46 101 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.66□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 SYCNQ0VAF6 134 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 ESRGQ1W209 222 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.65□□□□□ -1.34
VWA3B-217ENST00000489630 NOTCH2Q04721 2471 aa6.65□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 Q9BRP9 147 aa6.64□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.64□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 FAM168BA1KXE4 195 aa6.63□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 ATRQ13535 2644 aa6.63□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.63□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf137Q5JT78 98 aa6.63□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZRX8 168 aa6.62□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 DSCR10P59022 87 aa6.61□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 K7EQZ3 153 aa6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 TNP2Q05952 138 aa6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 Q8NBF4 154 aa6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0G2JQZ4 141 aa6.59□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 LCE6AA0A183 80 aa6.59□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PNN7 141 aa6.59□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 H3BNG1 76 aa6.59□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
VWA3B-217ENST00000489630 hDV103S1A0JD37 113 aa6.59□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 INAFM1C9JVW0 142 aa6.58□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.58□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.58□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 CASC10Q5T4H9 136 aa6.58□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 PRR4Q16378 134 aa6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 TENM3Q9P273 2699 aa6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 SPRR1AP35321 89 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 SPRR4Q96PI1 79 aa6.56□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1B0GW54 56 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFS5O43920 106 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2BP63146 152 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 F8P00451 2351 aa6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.54□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 HCG22E2RYF7 251 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP10-11P60412 298 aa6.53□□□□□ -1.36
VWA3B-217ENST00000489630 PSCAO43653 123 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.52□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 PSPHP1O15172 72 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms