RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 SDC2P34741 201 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R2P41236 205 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 GINS3Q9BRX5 216 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABARAPH6UMI1 98 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0QZK8 103 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 E2F6O75461 281 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A26Q70HW3 274 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATPIF1Q9UII2 106 aa-1.54□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 HBDP02042 147 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARF6P62330 175 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 REEP5Q00765 189 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALKAL2Q6UX46 152 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CROCCP2Q86T23 111 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC32Q9BV29 185 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-1.55□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BMG7 143 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFNGP01579 166 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCRAP04437 139 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100PP25815 95 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CMPK1P30085 196 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMED2Q15363 201 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFI27L1Q96BM0 104 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCEAL4Q96EI5 215 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 WFDC6Q9BQY6 131 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERG28Q9UKR5 140 aa-1.56□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCGB1A1P11684 91 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 BTG2P78543 158 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 DCDP81605 110 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLGLB1Q02325 96 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP126Q5VTH2 177 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC26Q8NHZ8 85 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRO1933Q9H354 126 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPVFQ9HCQ7 196 aa-1.57□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 UQCRQO14949 82 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 UQCRHP07919 91 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A6P12236 298 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB131AP59861 70 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL8P80075 99 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR13C6PQ8NH95 151 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRK1Q8WUW1 75 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 LXNQ9BS40 222 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-1.58□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIX6O95475 246 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACYP1P07311 99 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A11P31949 105 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIC13Q5XKP0 118 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHB2Q99623 299 aa-1.59□□□□□ -2.66
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC179H3BU77 68 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 EDDM3BP56851 147 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG3P63215 75 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAMD13Q5VXD3 122 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf33Q6P1S2 294 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP14Q86UN6 197 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM24BQ8N5W8 94 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP53Q96M91 514 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED11Q9P086 117 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 V9GYQ6 96 aa-1.6□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WWC5 75 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 OOSP1A8MZH6 123 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R1W7 72 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGN4O00479 90 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00694P0DN24 101 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPPP2P59282 170 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCBD1P61457 104 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 STX19Q8N4C7 294 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED31Q9Y3C7 131 aa-1.61□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 B2MP61769 119 aa-1.62□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-1.62□□□□□ -2.67
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-1.62□□□□□ -2.67
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