RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.41□□□□□ -0.58
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PTPRN-216ENST00000486480 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
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PTPRN-216ENST00000486480 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.38□□□□□ -0.59
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PTPRN-216ENST00000486480 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-216ENST00000486480 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.29□□□□□ -0.6
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PTPRN-216ENST00000486480 ERC2-IT1O76042 136 aa11.28□□□□□ -0.6
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PTPRN-216ENST00000486480 C6orf99Q4VX62 202 aa11.26□□□□□ -0.61
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PTPRN-216ENST00000486480 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
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PTPRN-216ENST00000486480 C12orf57Q99622 126 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1B0GWB2 263 aa11.18□□□□□ -0.62
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PTPRN-216ENST00000486480 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-216ENST00000486480 TSPAN13O95857 204 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRN-216ENST00000486480 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.11□□□□□ -0.63
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PTPRN-216ENST00000486480 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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PTPRN-216ENST00000486480 CTAG1AP78358 180 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-216ENST00000486480 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-216ENST00000486480 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.05□□□□□ -0.64
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PTPRN-216ENST00000486480 hADV29S1A0JD25 119 aa10.99□□□□□ -0.65
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PTPRN-216ENST00000486480 PRO1933Q9H354 126 aa10.97□□□□□ -0.65
PTPRN-216ENST00000486480 Q6ZQY7 126 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRN-216ENST00000486480 Q8N377 158 aa10.96□□□□□ -0.65
PTPRN-216ENST00000486480 K7ERJ3 54 aa10.94□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 H0YGX0 51 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 LRP2P98164 4655 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRN-216ENST00000486480 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.9□□□□□ -0.66
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