RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.57□□□□□ -1.2
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RABGEF1-207ENST00000484547 CRPP02741 224 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 MALP21145 153 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-207ENST00000484547 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L23D6RBM5 183 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYGAP11844 174 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-207ENST00000484547 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 C5orf47Q569G3 176 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-207ENST00000484547 UBL5Q9BZL1 73 aa7.33□□□□□ -1.24
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