RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 Q1RN00 199 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 ERG28Q9UKR5 140 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 A0A096LNI7 61 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 PANO1I0J062 215 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 COX8AP10176 69 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL5P42830 114 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 DPH3Q96FX2 82 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 FAM168BA1KXE4 195 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf90A8MZG2 172 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 Q8NDZ9 215 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H4GQ99525 98 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PNN7 141 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 DLEU1O43261 78 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 CTAG1AP78358 180 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 COX17Q14061 63 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00167Q96N53 147 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00587B1AMM8 73 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM238C9JI98 176 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TSTD3H0UI37 97 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 NCR3O14931 201 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TIMM17BO60830 172 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SFTA2Q6UW10 78 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZVH6 145 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 HIGD1BQ9P298 99 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 PKHD1P08F94 4074 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 TSPAN13O95857 204 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD2P54710 66 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SCXQ7RTU7 201 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 SPANXCQ9NY87 97 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf24Q9Y442 160 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 DDTP30046 118 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 BATFQ16520 125 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 CEND1Q8N111 149 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 A6NDN8 102 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 H7C2G1 150 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 K7ERJ3 54 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 M0QXV9 152 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV2D-28P01615 120 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 IFITM1P13164 125 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 HSD52Q0P140 79 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 LCE1CQ5T751 118 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZSA8 131 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-211ENST00000484135 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf33Q8WU49 177 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-211ENST00000484135 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-211ENST00000484135 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.89□□□□□ -1.95
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