RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482096.1

UBE2F-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative), human

TSL 4

Gene UBE2F, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2F-222	ENST00000482096	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	HERV-K104	P63124	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	S100A12	P80511	92 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096		Q9BRP9	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UBE2F-222	ENST00000482096	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096		Q6ZRX8	168 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	DDT	P30046	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	MT1H	P80294	61 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	RHEB	Q15382	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	IFITM2	Q01629	132 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	NDUFC2	O95298	119 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBE2F-222	ENST00000482096	LEPROT	O15243	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096		J3QQQ9	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	SPRR1B	P22528	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	HSBP1	O75506	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	NMU	P48645	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096		H0Y8G0	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	PLN	P26678	52 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	APOC3	P02656	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	HERVK_113	P61574	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	DPM2	O94777	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	SNAPIN	O95295	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	NPC2	P61916	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	CD164	Q04900	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096		Q75L30	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBE2F-222	ENST00000482096		A0A0J9YXY3	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096		M0R2T5	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	IGKC	P01834	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096		Q5XG85	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	SVBP	Q8N300	66 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096		E9PLD3	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096		H7C2G1	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	SERF1A	O75920	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	TAL2	Q16559	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	FABP4	P15090	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096		Q1RN00	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBE2F-222	ENST00000482096	LITAF	Q99732	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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