RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0U1RQV1 116 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 TIMM17BO60830 172 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 DDTP30046 118 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 Q8NBF4 154 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 B5MCH6 92 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFC2O95298 119 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.69□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB1D1O95968 90 aa7.68□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 TPRXLQ17RH7 258 aa7.68□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 C5orf52A6NGY3 159 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 ERC2-IT1O76042 136 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.67□□□□□ -1.18
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C9orf3-212ENST00000468164 LITAFQ99732 161 aa7.67□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 CTAG1AP78358 180 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 MOBPQ13875 183 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 SPANXCQ9NY87 97 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 MUC17Q685J3 4493 aa7.66□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZRX8 168 aa7.65□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 Q9BRP9 147 aa7.65□□□□□ -1.18
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C9orf3-212ENST00000468164 LINC00483Q53H64 154 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 PCP2Q8IVA1 136 aa7.64□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.64□□□□□ -1.19
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C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZVH6 145 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.63□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 SPINK1P00995 79 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV6-57P01721 117 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 IFITM1P13164 125 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.62□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-212ENST00000468164 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-212ENST00000468164 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-212ENST00000468164 A6NDN8 102 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-212ENST00000468164 Q8N377 158 aa7.55□□□□□ -1.2
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C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H4GQ99525 98 aa7.52□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 C6orf99Q4VX62 202 aa7.51□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 C14orf144Q96I85 54 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 A4D1N5 150 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 TAL2Q16559 108 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 Q1RN00 199 aa7.47□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GWB2 263 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 VAMP3Q15836 100 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR1BP22528 89 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 LIMD2Q9BT23 127 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 HIGD1BQ9P298 99 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 C12orf57Q99622 126 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 H7C2G1 150 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 PYY3Q5JQD4 70 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 XP32Q5T750 250 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf92A6NGG3 77 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 RAB37Q96AX2 223 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 PRO1933Q9H354 126 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 A6NJY4 79 aa7.39□□□□□ -1.23
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