RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0U1RQV1 116 aa7.71□□□□□ -1.18
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C9orf3-212ENST00000468164 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.71□□□□□ -1.18
C9orf3-212ENST00000468164 Q8NBF4 154 aa7.71□□□□□ -1.18
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C9orf3-212ENST00000468164 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.7□□□□□ -1.18
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C9orf3-212ENST00000468164 C14orf144Q96I85 54 aa7.5□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-212ENST00000468164 A4D1N5 150 aa7.48□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 TAL2Q16559 108 aa7.48□□□□□ -1.21
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C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GWB2 263 aa7.46□□□□□ -1.22
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C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR1BP22528 89 aa7.45□□□□□ -1.22
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C9orf3-212ENST00000468164 LIMD2Q9BT23 127 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 HIGD1BQ9P298 99 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 C12orf57Q99622 126 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 H7C2G1 150 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 PYY3Q5JQD4 70 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 XP32Q5T750 250 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf92A6NGG3 77 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 RAB37Q96AX2 223 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 PRO1933Q9H354 126 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 A6NJY4 79 aa7.39□□□□□ -1.23
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