RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	APC2	O95996	2303 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		Q5XG85	94 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	SPEG	Q15772	3267 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		F8WEM9	126 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	MIF	P14174	115 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	COX7B	P24311	80 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	NREP	Q16612	68 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	DIRC1	Q969H9	104 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	ACACA	Q13085	2346 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTA1	P02549	2419 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		H7BZZ5	65 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	SNURF	Q9Y675	71 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTBN2	O15020	2390 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	SPAG11B	Q08648	103 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6ZQY7	126 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		Q9BRP9	147 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	MED13L	Q71F56	2210 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	CACNA1B	Q00975	2339 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	2.97	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378	EYS	Q5T1H1	3165 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A096LNT2	108 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A096LPF7	62 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378		M0R378	163 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV1-51	P01701	117 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	KALRN	O60229	2985 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	COL6A3	P12111	3177 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	TACC2	O95359	2948 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ESRG	Q1W209	222 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	LELP1	Q5T871	98 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	LRBA	P50851	2863 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF292	O60281	2723 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378		M0R2N4	97 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFB1	O75438	58 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	C3orf84	H3BNL1	204 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	HTN3	P15516	51 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	AKAP13	Q12802	2813 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		2.9	□□□□□ -1.94
RBBP4-208	ENST00000463378	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	SORL1	Q92673	2214 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	NBAS	A2RRP1	2371 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378		Q1T7F1	81 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378		Q8NDZ9	215 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	MGA	Q8IWI9	3026 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB135	Q30KP9	77 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf137	Q5JT78	98 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	PRR15	Q8IV56	129 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	DMD	P11532	3685 aa		2.88	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.7 ms