RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461507.5

FDPS-204, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, human

TSL 2

Gene FDPS, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FDPS-204	ENST00000461507	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	LPA	P08519	4548 aa		7.57	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	CRYGA	P11844	174 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	IFITM1	P13164	125 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	SPRR1A	P35321	89 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507		A0A087X002	238 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507		A6NDN8	102 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507		Q6ZVH6	145 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FDPS-204	ENST00000461507		B5MCH6	92 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507		Q6ZRX8	168 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	TSPAN13	O95857	204 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	C14orf144	Q96I85	54 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	COX8A	P10176	69 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	COX7B	P24311	80 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	C6orf99	Q4VX62	202 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507		Q9BRP9	147 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FDPS-204	ENST00000461507	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	C12orf57	Q99622	126 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507		A4D1N5	150 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	DLEU1	O43261	78 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	PRR4	Q16378	134 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	MOBP	Q13875	183 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507		A0A1B0GWB2	263 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507		H7C2G1	150 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FDPS-204	ENST00000461507	TAL2	Q16559	108 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507		Q8NBF4	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	VAMP3	Q15836	100 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	SLC25A20	O43772	301 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	HIGD1B	Q9P298	99 aa		7.37	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507		Q1RN00	199 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		7.36	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	MUC2	Q02817	5179 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	CTAG1A	P78358	180 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.35	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507		A6NJY4	79 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.34	□□□□□ -1.23
FDPS-204	ENST00000461507	CEND1	Q8N111	149 aa		7.33	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	CFC1	P0CG37	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	MUC17	Q685J3	4493 aa		7.32	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507		A0A0B4J2C4	111 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	FXYD2	P54710	66 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	HSD52	Q0P140	79 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	hADV29S1	A0JD25	119 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	SPRR1B	P22528	89 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	LINC00575	Q6W349	94 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	SPINK1	P00995	79 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507	TPRXL	Q17RH7	258 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507		Q6ZQY7	126 aa		7.28	□□□□□ -1.24
FDPS-204	ENST00000461507		F8WEM9	126 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FDPS-204	ENST00000461507	PRO1933	Q9H354	126 aa		7.27	□□□□□ -1.25
FDPS-204	ENST00000461507		A0A0U1RQV1	116 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FDPS-204	ENST00000461507	SNCG	O76070	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FDPS-204	ENST00000461507	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FDPS-204	ENST00000461507	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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