RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.02□□□□□ -0.81
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RABGEF1-204ENST00000442563 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-204ENST00000442563 B5MCH6 92 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-204ENST00000442563 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10□□□□□ -0.81
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RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087X002 238 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-204ENST00000442563 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.98□□□□□ -0.81
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RABGEF1-204ENST00000442563 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.97□□□□□ -0.81
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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RABGEF1-204ENST00000442563 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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RABGEF1-204ENST00000442563 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.94□□□□□ -0.82
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RABGEF1-204ENST00000442563 C14orf144Q96I85 54 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 A4D1N5 150 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 COX7BP24311 80 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.8□□□□□ -0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.79□□□□□ -0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.78□□□□□ -0.84
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RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf57Q99622 126 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.7□□□□□ -0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A20O43772 301 aa9.69□□□□□ -0.86
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RABGEF1-204ENST00000442563 HSD52Q0P140 79 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM29Q86T20 159 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD2P54710 66 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8N377 158 aa9.63□□□□□ -0.87
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RABGEF1-204ENST00000442563 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.62□□□□□ -0.87
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RABGEF1-204ENST00000442563 H0YGX0 51 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 Q1RN00 199 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZQY7 126 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 PRO1933Q9H354 126 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.57□□□□□ -0.88
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