RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0087Q14695 138 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf84H3BNL1 204 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7BP24311 80 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 REG3GQ6UW15 175 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM29Q86T20 159 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK12Q9UKR0 248 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 LCA10Q71F78 164 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV6-57P01721 117 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 DIRC1Q969H9 104 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A096LPF7 62 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BQ85 93 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 F8P00451 2351 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM229AH3BQW9 127 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 SYCNQ0VAF6 134 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-203ENST00000439720 ZANQ9Y493 2812 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.59□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 PSCAO43653 123 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf74Q96GX8 76 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPEQ02224 2701 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB130BP0DP73 79 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB130AP0DP74 79 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 HIVEP2P31629 2446 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-3P60369 221 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GUV1 79 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 Q5VV11 94 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2BP63146 152 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG11BQ08648 103 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE6AA0A183 80 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf90A8MZG2 172 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01554Q52M75 96 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 SONP18583 2426 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2AP49459 152 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 DNHD1Q96M86 4753 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV1-51P01701 117 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YWU9 116 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 HCG22E2RYF7 251 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR15LQ9BU68 103 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 POLQO75417 2590 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK2AP2O75956 126 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EQZ3 153 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 NF1P21359 2839 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 B9D2Q9BPU9 175 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCR10P59022 87 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PNM2 257 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NED7 52 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB1O75438 58 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N377 158 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO0255Q9UI72 69 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMD2Q9BT23 127 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00208Q96KT6 92 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NN06 94 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.44□□□□□ -1.54
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