RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 GAGE2BQ13066 116 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 FAM168BA1KXE4 195 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 NCR3O14931 201 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 CHTF8P0CG12 524 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.22□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.22□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 TAX1BP3O14907 124 aa6.22□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
ATG4B-211ENST00000429899 TSPAN13O95857 204 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 RAB37Q96AX2 223 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.21□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 REG3GQ6UW15 175 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.2□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PNN7 141 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV6-57P01721 117 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 C7orf33Q8WU49 177 aa6.19□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 A0A087WYN8 130 aa6.18□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 M0R378 163 aa6.18□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.18□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 DPH3Q96FX2 82 aa6.18□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 C9orf118A6NHY6 69 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 M0QXV9 152 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 C22orf24Q9Y442 160 aa6.17□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 H7C2G1 150 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 PRR4Q16378 134 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM126AQ9H061 195 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.16□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 H3BUT2 72 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 TRIAP1O43715 76 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 Q1RN00 199 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00167Q96N53 147 aa6.15□□□□□ -1.42
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PPM0 123 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 GAGE10A6NGK3 116 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 PRYO14603 147 aa6.13□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.13□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 SPRR1AP35321 89 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.12□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 C6orf99Q4VX62 202 aa6.11□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GV90 55 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 PSMB2P49721 201 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 DIRC1Q969H9 104 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.1□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 FABP2P12104 132 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 K7EP34 96 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 UBE2BP63146 152 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 CLEC2BQ92478 149 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 MUC17Q685J3 4493 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 LST1O00453 97 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 TCL1BO95988 128 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 COX6CP09669 75 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.07□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 B5MCH6 92 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 H0YGX0 51 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 COX7BP24311 80 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZRX8 168 aa6.06□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 VAMP3Q15836 100 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 BCE1O60756 84 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 ATXN8Q156A1 80 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00575Q6W349 94 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.04□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GX51 115 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 TRACP01848 142 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 Q9BRP9 147 aa6.03□□□□□ -1.44
ATG4B-211ENST00000429899 H0Y9J4 135 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4B-211ENST00000429899 H3BMG7 143 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4B-211ENST00000429899 PRLHP81277 87 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4B-211ENST00000429899 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.02□□□□□ -1.45
ATG4B-211ENST00000429899 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.02□□□□□ -1.45
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