RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 ZNF575Q86XF7 245 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 WIPF1O43516 503 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 SVIPQ8NHG7 77 aa6.74□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 PCNTO95613 3336 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 CASC10Q5T4H9 136 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-201ENST00000389757 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 Q96NJ1 140 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 PRO0461Q9UI25 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 CDIP1Q9H305 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 C8orf87E5RJ46 101 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 LAMA3Q16787 3333 aa6.68□□□□□ -1.34
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PKP4-201ENST00000389757 IGLV7-43P04211 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 A0A1W2PNN7 141 aa6.67□□□□□ -1.34
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PKP4-201ENST00000389757 IGFL1Q6UW32 110 aa6.65□□□□□ -1.34
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PKP4-201ENST00000389757 TNP2Q05952 138 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-201ENST00000389757 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.65□□□□□ -1.35
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PKP4-201ENST00000389757 H3BPC8 53 aa6.64□□□□□ -1.35
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PKP4-201ENST00000389757 A0A0U1RQV1 116 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 SPRR4Q96PI1 79 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 K7EQZ3 153 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 STAB1Q9NY15 2570 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-201ENST00000389757 AKAP13Q12802 2813 aa6.59□□□□□ -1.35
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PKP4-201ENST00000389757 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-201ENST00000389757 DSCR10P59022 87 aa6.58□□□□□ -1.36
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PKP4-201ENST00000389757 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.57□□□□□ -1.36
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PKP4-201ENST00000389757 PRR15Q8IV56 129 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-201ENST00000389757 BRCA2P51587 3418 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GU69 56 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-201ENST00000389757 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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PKP4-201ENST00000389757 A0A0C4DFX4 3053 aa6.5□□□□□ -1.37
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PKP4-201ENST00000389757 CHD6Q8TD26 2715 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-201ENST00000389757 PMAIP1Q13794 54 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-201ENST00000389757 FAM104AQ969W3 186 aa6.47□□□□□ -1.37
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PKP4-201ENST00000389757 CFAP54Q96N23 3096 aa6.44□□□□□ -1.38
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PKP4-201ENST00000389757 TRIOO75962 3097 aa6.4□□□□□ -1.39
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PKP4-201ENST00000389757 Q6ZSA8 131 aa6.36□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 LINC01600Q96MT4 127 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 SPRR1AP35321 89 aa6.35□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-201ENST00000389757 Q5VSD8 79 aa6.33□□□□□ -1.4
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