RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367740.2

VAMP4-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-202ENST00000367740 IGLC3P0DOY3 106 aa7.48□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 SFTA2Q6UW10 78 aa7.48□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.48□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.48□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP10-10P60014 251 aa7.47□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.47□□□□□ -1.21
VAMP4-202ENST00000367740 C1orf195Q5TG92 126 aa7.46□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 C9JQL5 133 aa7.45□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 SNAPINO95295 136 aa7.45□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 C20orf202A1L168 122 aa7.44□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 H7C2G1 150 aa7.43□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.43□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 LINC01549A6NIU2 74 aa7.42□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 SMIM13P0DJ93 91 aa7.42□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.42□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 DDTP30046 118 aa7.41□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 CD164Q04900 197 aa7.41□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 Q5XG85 94 aa7.41□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.41□□□□□ -1.22
VAMP4-202ENST00000367740 LINC01546A6NGU7 62 aa7.39□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 SPRR1BP22528 89 aa7.39□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 IFITM2Q01629 132 aa7.39□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.39□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 SMIM29Q86T20 159 aa7.38□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 C5orf52A6NGY3 159 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 C11orf86A6NJI1 115 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 NDUFA6P56556 154 aa7.35□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.35□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.35□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.35□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 FA2HQ7L5A8 372 aa7.35□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.34□□□□□ -1.23
VAMP4-202ENST00000367740 Q75L30 129 aa7.33□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.33□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 Q1RN00 199 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 PRO1933Q9H354 126 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 A0A096LNJ9 63 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 TMEM223A0PJW6 202 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 PEA15Q15121 130 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP4-202ENST00000367740 A0A0G2JQZ4 141 aa7.27□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 HERV-K104P63124 156 aa7.27□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.26□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.26□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 BAGE3Q86Y29 109 aa7.25□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00587B1AMM8 73 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 PCP4P48539 62 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 AKR1D1P51857 326 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.24□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 C12orf57Q99622 126 aa7.23□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 S100PP25815 95 aa7.22□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 PCP2Q8IVA1 136 aa7.22□□□□□ -1.25
VAMP4-202ENST00000367740 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 NDUFC2O95298 119 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 HBDP02042 147 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 MT-ND4LP03901 98 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 FAM236CP0DP71 79 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 TCL1BO95988 128 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 SMIM6P0DI80 62 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 C6orf99Q4VX62 202 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.19□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 MDN1Q9NU22 5596 aa7.18□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.18□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 PMCHL1Q16048 86 aa7.18□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 TAL2Q16559 108 aa7.18□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.18□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.17□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.17□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.16□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 COMMD7Q86VX2 200 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP4-202ENST00000367740 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 Q96NJ1 140 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 NPC2P61916 151 aa7.11□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.1□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 A8MUU9 505 aa7.1□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 CLLU1Q5K131 121 aa7.1□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 IGFL1Q6UW32 110 aa7.1□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 KMT2DO14686 5537 aa7.09□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 LINC00614P0C842 121 aa7.09□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 COX7BP24311 80 aa7.09□□□□□ -1.27
VAMP4-202ENST00000367740 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.08□□□□□ -1.28
VAMP4-202ENST00000367740 HRES1P13985 223 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms