RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SPRR4Q96PI1 79 aa15.85■□□□□ 0.13
TPGS1-201ENST00000359315 UBR4Q5T4S7 5183 aa15.84■□□□□ 0.13
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.84■□□□□ 0.13
TPGS1-201ENST00000359315 S100A12P80511 92 aa15.84■□□□□ 0.13
TPGS1-201ENST00000359315 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.84■□□□□ 0.13
TPGS1-201ENST00000359315 ERC2-IT1O76042 136 aa15.81■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 Q9BRP9 147 aa15.81■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZRX8 168 aa15.79■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf22Q8N5N4 141 aa15.79■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 LRP2P98164 4655 aa15.78■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.77■□□□□ 0.12
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN13O95857 204 aa15.76■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.76■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.74■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 SCGB1D1O95968 90 aa15.74■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 MUSTN1Q8IVN3 82 aa15.74■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 IFITM1P13164 125 aa15.71■□□□□ 0.11
TPGS1-201ENST00000359315 GAGE2AQ6NT46 116 aa15.69■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZVH6 145 aa15.69■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.69■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00483Q53H64 154 aa15.68■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00304Q8N9R0 145 aa15.68■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf99Q4VX62 202 aa15.64■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 COPS9Q8WXC6 57 aa15.64■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 CBY1Q9Y3M2 126 aa15.64■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa15.63■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 LPAP08519 4548 aa15.62■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 PRR4Q16378 134 aa15.61■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 A6NDN8 102 aa15.6■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TPGS1-201ENST00000359315 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 COX8AP10176 69 aa15.57■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 COX7BP24311 80 aa15.57■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 Q8NBF4 154 aa15.56■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.56■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa15.55■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.55■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 MOBPQ13875 183 aa15.54■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 A4D1N5 150 aa15.53■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA45Q537H7 98 aa15.52■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 C14orf144Q96I85 54 aa15.52■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.52■□□□□ 0.08
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.51■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.5■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 DLEU1O43261 78 aa15.48■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa15.47■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf57Q99622 126 aa15.47■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP8Q9BV40 100 aa15.47■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H4GQ99525 98 aa15.46■□□□□ 0.07
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GWB2 263 aa15.45■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 SPAG11AQ6PDA7 123 aa15.45■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 SPRR1BP22528 89 aa15.44■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 PYY3Q5JQD4 70 aa15.42■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf153Q5TBE3 101 aa15.42■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.42■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 CTAG1AP78358 180 aa15.41■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf48Q5BLP8 95 aa15.41■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.41■□□□□ 0.06
TPGS1-201ENST00000359315 RNF213Q63HN8 5207 aa15.39■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB105AQ8NG35 78 aa15.39■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.38■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 HIGD1BQ9P298 99 aa15.36■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK1P00995 79 aa15.35■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 TAL2Q16559 108 aa15.35■□□□□ 0.05
TPGS1-201ENST00000359315 Q1RN00 199 aa15.33■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa15.31■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa15.31■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa15.3■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM29Q86T20 159 aa15.3■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa15.3■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 CFC1BP0CG36 223 aa15.29■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 CFC1P0CG37 223 aa15.29■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00575Q6W349 94 aa15.28■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 Q8N377 158 aa15.27■□□□□ 0.04
TPGS1-201ENST00000359315 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 H7C2G1 150 aa15.25■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 RPS29P62273 56 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP3Q15836 100 aa15.25■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 TPRXLQ17RH7 258 aa15.23■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 CEND1Q8N111 149 aa15.23■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.22■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0B4J2C4 111 aa15.21■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A20O43772 301 aa15.21■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 RAB37Q96AX2 223 aa15.21■□□□□ 0.03
TPGS1-201ENST00000359315 FXYD2P54710 66 aa15.2■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JQZ4 141 aa15.19■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 hADV29S1A0JD25 119 aa15.19■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZQY7 126 aa15.19■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.16■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 PRO1933Q9H354 126 aa15.15■□□□□ 0.02
TPGS1-201ENST00000359315 CDIP1Q9H305 208 aa15.13■□□□□ 0.01
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.11■□□□□ 0.01
TPGS1-201ENST00000359315 HSD52Q0P140 79 aa15.1■□□□□ 0.01
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms