RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.82□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.81□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.8□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 AKAP9Q99996 3911 aa6.8□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.8□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 PRR15LQ9BU68 103 aa6.8□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 DEFB135Q30KP9 77 aa6.79□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.79□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.78□□□□□ -1.32
CLDN1-201ENST00000295522 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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CLDN1-201ENST00000295522 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.77□□□□□ -1.33
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CLDN1-201ENST00000295522 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 A6NED7 52 aa6.77□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 K7EQZ3 153 aa6.77□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 Q6ZRU5 148 aa6.77□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 Q1T7F1 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.76□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 A0A0G2JQZ4 141 aa6.76□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 A0A1W2PNN7 141 aa6.76□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 M0R378 163 aa6.76□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 MP68P56378 58 aa6.76□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 CD164Q04900 197 aa6.76□□□□□ -1.33
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CLDN1-201ENST00000295522 SYCNQ0VAF6 134 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLDN1-201ENST00000295522 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.75□□□□□ -1.33
CLDN1-201ENST00000295522 UBE2BP63146 152 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLDN1-201ENST00000295522 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLDN1-201ENST00000295522 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLDN1-201ENST00000295522 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 FSHBP01225 129 aa6.7□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.7□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 ATRQ13535 2644 aa6.7□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 Q5VV11 94 aa6.69□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 J3QKU1 62 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLDN1-201ENST00000295522 X6R8D5 127 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLDN1-201ENST00000295522 LELP1Q5T871 98 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLDN1-201ENST00000295522 H0Y9P7 68 aa6.65□□□□□ -1.34
CLDN1-201ENST00000295522 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.65□□□□□ -1.35
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CLDN1-201ENST00000295522 A0A096LNI7 61 aa6.64□□□□□ -1.35
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CLDN1-201ENST00000295522 LIMD2Q9BT23 127 aa6.63□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.63□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 FAM168BA1KXE4 195 aa6.63□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLDN1-201ENST00000295522 H0Y9J4 135 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 CASC2Q6XLA1 102 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 Q6ZRX8 168 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 LCA10Q71F78 164 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.59□□□□□ -1.35
CLDN1-201ENST00000295522 Q9BRP9 147 aa6.59□□□□□ -1.35
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CLDN1-201ENST00000295522 APOC4P55056 127 aa6.57□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.57□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 COA5Q86WW8 74 aa6.57□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.57□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.57□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 LCE6AA0A183 80 aa6.56□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 NDUFS5O43920 106 aa6.56□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.56□□□□□ -1.36
CLDN1-201ENST00000295522 PRLHP81277 87 aa6.55□□□□□ -1.36
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