RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZQT0 140 aa6.43□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.43□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.43□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.42□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 A8MWP4 228 aa6.42□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.41□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 A0A096LNJ9 63 aa6.41□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.4□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 Q96NJ1 140 aa6.4□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 ITPR1Q14643 2758 aa6.4□□□□□ -1.38
CUX1-201ENST00000292535 J3QL48 77 aa6.4□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.4□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 NF1P21359 2839 aa6.4□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 CDIP1Q9H305 208 aa6.39□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 LINC00315P59091 139 aa6.39□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.39□□□□□ -1.39
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CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PPR1 153 aa6.38□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 CHTF8P0CG12 524 aa6.38□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 KALRNO60229 2985 aa6.38□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.37□□□□□ -1.39
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CUX1-201ENST00000292535 ERC2-IT1O76042 136 aa6.35□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 C5orf42Q9H799 3197 aa6.35□□□□□ -1.39
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CUX1-201ENST00000292535 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
CUX1-201ENST00000292535 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.34□□□□□ -1.39
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CUX1-201ENST00000292535 C4orf26Q17RF5 130 aa6.32□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 C10orf142B7Z368 130 aa6.32□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 APLNQ9ULZ1 77 aa6.32□□□□□ -1.4
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CUX1-201ENST00000292535 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.31□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 LRBAP50851 2863 aa6.3□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 IGLV6-57P01721 117 aa6.3□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.29□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.28□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 COA5Q86WW8 74 aa6.28□□□□□ -1.4
CUX1-201ENST00000292535 TACC2O95359 2948 aa6.27□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 TENM3Q9P273 2699 aa6.27□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.26□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.26□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 FAM168BA1KXE4 195 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 K7EQZ3 153 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 PRO0461Q9UI25 63 aa6.25□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.24□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 IGFL1Q6UW32 110 aa6.24□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 ZZEF1O43149 2961 aa6.23□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 LUZP6Q538Z0 58 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GVX0 72 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 ZNF861PO60384 105 aa6.21□□□□□ -1.41
CUX1-201ENST00000292535 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.2□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 LAMA1P25391 3075 aa6.2□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 DSCR10P59022 87 aa6.2□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 HIVEP1P15822 2718 aa6.2□□□□□ -1.42
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CUX1-201ENST00000292535 C9orf92A6NGG3 77 aa6.18□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 KLK9Q2XQG4 91 aa6.18□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.18□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 PRR34Q9NV39 138 aa6.17□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.17□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 COL12A1Q99715 3063 aa6.17□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 C15orf56Q8N910 161 aa6.17□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 LITAFQ99732 161 aa6.17□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 LINC01554Q52M75 96 aa6.16□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 PDZD2O15018 2839 aa6.16□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.16□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.16□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.15□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 REV3LO60673 3130 aa6.15□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 A8MUN3 132 aa6.15□□□□□ -1.42
CUX1-201ENST00000292535 K7EIL1 84 aa6.14□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.14□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 A0A0D9SG42 100 aa6.14□□□□□ -1.43
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