RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 Q8N9L7 120 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 Q6ZQY7 126 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 COX17Q14061 63 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 PDE6GP18545 87 aa8.87□□□□□ -0.99
HOXB13-201ENST00000290295 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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HOXB13-201ENST00000290295 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.86□□□□□ -0.99
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HOXB13-201ENST00000290295 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.85□□□□□ -0.99
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HOXB13-201ENST00000290295 PSPHP1O15172 72 aa8.81□□□□□ -1
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HOXB13-201ENST00000290295 PSCAO43653 123 aa8.78□□□□□ -1
HOXB13-201ENST00000290295 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
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HOXB13-201ENST00000290295 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.77□□□□□ -1.01
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HOXB13-201ENST00000290295 IGKV4-1P06312 121 aa8.69□□□□□ -1.02
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HOXB13-201ENST00000290295 PRR34Q9NV39 138 aa8.67□□□□□ -1.02
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HOXB13-201ENST00000290295 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXB13-201ENST00000290295 SMIM29Q86T20 159 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXB13-201ENST00000290295 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXB13-201ENST00000290295 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXB13-201ENST00000290295 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.65□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 H3BNG1 76 aa8.64□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 PRR15Q8IV56 129 aa8.64□□□□□ -1.03
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HOXB13-201ENST00000290295 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.64□□□□□ -1.03
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HOXB13-201ENST00000290295 A8MUN3 132 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 AKAP9Q99996 3911 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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HOXB13-201ENST00000290295 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 M0R378 163 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2BP63146 152 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXB13-201ENST00000290295 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.59□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 A8MU10 97 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 VPREB1P12018 145 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 C15orf56Q8N910 161 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 CD164Q04900 197 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 Q1T7F1 81 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 CASC10Q5T4H9 136 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXB13-201ENST00000290295 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXB13-201ENST00000290295 A6NED7 52 aa8.46□□□□□ -1.05
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HOXB13-201ENST00000290295 LINC00208Q96KT6 92 aa8.46□□□□□ -1.05
HOXB13-201ENST00000290295 A0A1W2PNM2 257 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB13-201ENST00000290295 MP68P56378 58 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2AP49459 152 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXB13-201ENST00000290295 K7EQZ3 153 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXB13-201ENST00000290295 C1orf137Q5JT78 98 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXB13-201ENST00000290295 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.45□□□□□ -1.06
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