RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf17Q9NRJ1 99 aa13.89□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.87□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 USP24Q9UPU5 2620 aa13.86□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.86□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01600Q96MT4 127 aa13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.85□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-11P60412 298 aa13.83□□□□□ -0.19
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVX0 72 aa13.82□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 H7BZZ5 65 aa13.82□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF861PO60384 105 aa13.82□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 UQCR11O14957 56 aa13.82□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 K7EIL1 84 aa13.81□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.8□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 MGAM2Q2M2H8 2515 aa13.77□□□□□ -0.2
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP10-3P60369 221 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-201ENST00000284617 DSCR10P59022 87 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WTM6 91 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PNM2 257 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JQZ4 141 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PNN7 141 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.65□□□□□ -0.22
CCSAP-201ENST00000284617 MIR22HGQ0VDD5 57 aa13.65□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa13.64□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF575Q86XF7 245 aa13.63□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR4Q96PI1 79 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.62□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPINT4Q6UDR6 99 aa13.61□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV7-43P04211 117 aa13.6□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 CASC10Q5T4H9 136 aa13.58□□□□□ -0.23
CCSAP-201ENST00000284617 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.58□□□□□ -0.24
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.56□□□□□ -0.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.55□□□□□ -0.24
CCSAP-201ENST00000284617 APLNQ9ULZ1 77 aa13.54□□□□□ -0.24
CCSAP-201ENST00000284617 ATRQ13535 2644 aa13.53□□□□□ -0.24
CCSAP-201ENST00000284617 MAST4O15021 2626 aa13.52□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 BPTFQ12830 3046 aa13.49□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 OCR1Q9BZK8 76 aa13.48□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 CRIPTQ9P021 101 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf92A6NGG3 77 aa13.47□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 FAM104AQ969W3 186 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 CD164Q04900 197 aa13.46□□□□□ -0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa13.44□□□□□ -0.26
CCSAP-201ENST00000284617 J3QL48 77 aa13.43□□□□□ -0.26
CCSAP-201ENST00000284617 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.4□□□□□ -0.26
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-201ENST00000284617 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-201ENST00000284617 LCA10Q71F78 164 aa13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-201ENST00000284617 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-201ENST00000284617 Q1T7F1 81 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-201ENST00000284617 CR1P17927 2039 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-201ENST00000284617 ITPR3Q14573 2671 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N1X5 172 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-201ENST00000284617 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-201ENST00000284617 PRR26Q8N8Z3 221 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.27□□□□□ -0.29
CCSAP-201ENST00000284617 WIPF1O43516 503 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-201ENST00000284617 UTRNP46939 3433 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 CEP350Q5VT06 3117 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR1AP35321 89 aa13.19□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 TNP2Q05952 138 aa13.16□□□□□ -0.3
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0D9SG42 100 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 Q8NDZ9 215 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 HRES1P13985 223 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 FAM229BQ4G0N7 80 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 Q75L30 129 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 STAB1Q9NY15 2570 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-201ENST00000284617 CENPEQ02224 2701 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01554Q52M75 96 aa13.08□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 SPRR1BP22528 89 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GU33 70 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP13Q12802 2813 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 Q5XG85 94 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00472Q9H8W2 130 aa12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSA8 131 aa12.96□□□□□ -0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-201ENST00000284617 CHD6Q8TD26 2715 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.87□□□□□ -0.35
CCSAP-201ENST00000284617 Q5W150 140 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms