RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 DSCR9P59020 149 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB135Q30KP9 77 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRR-201ENST00000283228 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRR-201ENST00000283228 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 PCOTHQ58A44 107 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 PDZD2O15018 2839 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 LIMD2Q9BT23 127 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 A0A096LNI7 61 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRR-201ENST00000283228 PRR34Q9NV39 138 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-201ENST00000283228 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-201ENST00000283228 APOC4P55056 127 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRR-201ENST00000283228 Q9BRP9 147 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-201ENST00000283228 C15orf56Q8N910 161 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRR-201ENST00000283228 J3QKU1 62 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-201ENST00000283228 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFS5O43920 106 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-201ENST00000283228 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 PRLHP81277 87 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 HIVEP1P15822 2718 aa7.32□□□□□ -1.24
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