RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 MTORP42345 2549 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 Q8N9L7 120 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 NUPR2A6NF83 97 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-201ENST00000264345 SMIM29Q86T20 159 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 PRR15LQ9BU68 103 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 M0R2N4 97 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 LINC00208Q96KT6 92 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 H7BZZ5 65 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 PRO0628Q9UI54 55 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 SEC61GP60059 68 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WSZ3 146 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 CASC2Q6XLA1 102 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 FAM168BA1KXE4 195 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 H3BPC8 53 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 hDV103S1A0JD37 113 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 PRLHP81277 87 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 ATMQ13315 3056 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 ITPR3Q14573 2671 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 SPRR1AP35321 89 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 ACANP16112 2415 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-201ENST00000264345 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PNM2 257 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 SPRR4Q96PI1 79 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 USP24Q9UPU5 2620 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 KALRNO60229 2985 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 TACC2O95359 2948 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 PCOTHQ58A44 107 aa5.7□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 H0Y9P7 68 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 K7EIL1 84 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 IGFL1Q6UW32 110 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 EPM2AB3EWF7 344 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 OCR1Q9BZK8 76 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 LAMA5O15230 3695 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 K7EQZ3 153 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 CASC10Q5T4H9 136 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 BSNQ9UPA5 3926 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 A8MWP4 228 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-201ENST00000264345 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 K7ERS5 55 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 MDFIQ99750 246 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 CHD6Q8TD26 2715 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 APLNQ9ULZ1 77 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 TNP2Q05952 138 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 PRR15Q8IV56 129 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PNN7 141 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 DSCR10P59022 87 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 MOBPQ13875 183 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 FLNCQ14315 2725 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 Q5XG85 94 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 LIMD2Q9BT23 127 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 CHTF8P0CG12 524 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 SPRR1BP22528 89 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
HERC3-201ENST00000264345 ITPR1Q14643 2758 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 SPINK1P00995 79 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 RTL8CO15255 209 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 OXTP01178 125 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 CENPEQ02224 2701 aa5.55□□□□□ -1.52
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