RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 HIVEP1P15822 2718 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 A0A087WVE0 104 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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TTPAL-201ENST00000262605 C16orf90A8MZG2 172 aa6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.8□□□□□ -1.32
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TTPAL-201ENST00000262605 IGLV6-57P01721 117 aa6.79□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 CDIP1Q9H305 208 aa6.78□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.78□□□□□ -1.32
TTPAL-201ENST00000262605 COL6A5A8TX70 2615 aa6.78□□□□□ -1.32
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TTPAL-201ENST00000262605 A0A087WSZ3 146 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.73□□□□□ -1.33
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TTPAL-201ENST00000262605 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.73□□□□□ -1.33
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TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PNN7 141 aa6.71□□□□□ -1.34
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TTPAL-201ENST00000262605 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-201ENST00000262605 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZQT0 140 aa6.69□□□□□ -1.34
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TTPAL-201ENST00000262605 IGKV4-1P06312 121 aa6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.68□□□□□ -1.34
TTPAL-201ENST00000262605 MOBPQ13875 183 aa6.68□□□□□ -1.34
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TTPAL-201ENST00000262605 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.67□□□□□ -1.34
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-201ENST00000262605 SERP2Q8N6R1 65 aa6.65□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.65□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 ERC2-IT1O76042 136 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 COX7CP15954 63 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.61□□□□□ -1.35
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TTPAL-201ENST00000262605 Q8N377 158 aa6.61□□□□□ -1.35
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TTPAL-201ENST00000262605 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.61□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.6□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 PRR4Q16378 134 aa6.6□□□□□ -1.35
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TTPAL-201ENST00000262605 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.6□□□□□ -1.35
TTPAL-201ENST00000262605 Q8NBF4 154 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 CASC2Q6XLA1 102 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 CXCL6P80162 114 aa6.58□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM29Q86T20 159 aa6.57□□□□□ -1.36
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TTPAL-201ENST00000262605 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 HCG22E2RYF7 251 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 IGFL1Q6UW32 110 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.56□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 FAM236CP0DP71 79 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.55□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 J3KT08 172 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00208Q96KT6 92 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.53□□□□□ -1.36
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF861PO60384 105 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-201ENST00000262605 SVIPQ8NHG7 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-201ENST00000262605 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.51□□□□□ -1.37
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.5□□□□□ -1.37
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