RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-201ENST00000171887 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 LINC01554Q52M75 96 aa6.32□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 PRR15Q8IV56 129 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 COL4A2P08572 1712 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 IGLV6-57P01721 117 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 CDSNQ15517 529 aa6.3□□□□□ -1.4
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TNS1-201ENST00000171887 KLKP1Q107X0 134 aa6.3□□□□□ -1.4
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TNS1-201ENST00000171887 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.29□□□□□ -1.4
TNS1-201ENST00000171887 FAM168BA1KXE4 195 aa6.28□□□□□ -1.4
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TNS1-201ENST00000171887 KRTAP10-9P60411 292 aa6.23□□□□□ -1.41
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TNS1-201ENST00000171887 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.18□□□□□ -1.42
TNS1-201ENST00000171887 J3QL48 77 aa6.18□□□□□ -1.42
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TNS1-201ENST00000171887 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.14□□□□□ -1.43
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TNS1-201ENST00000171887 A0A0A0MQY5 61 aa6.11□□□□□ -1.43
TNS1-201ENST00000171887 EP400Q96L91 3159 aa6.11□□□□□ -1.43
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TNS1-201ENST00000171887 C15orf56Q8N910 161 aa6.09□□□□□ -1.44
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TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PNN7 141 aa6.08□□□□□ -1.44
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TNS1-201ENST00000171887 SPRR4Q96PI1 79 aa6□□□□□ -1.45
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TNS1-201ENST00000171887 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TNS1-201ENST00000171887 UTRNP46939 3433 aa5.97□□□□□ -1.45
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TNS1-201ENST00000171887 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.96□□□□□ -1.45
TNS1-201ENST00000171887 PRAC1Q96KF2 57 aa5.96□□□□□ -1.45
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