RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 GAGE2EQ4V326 116 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 Q8N814 137 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 Q8NDZ9 215 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 KMT2AQ03164 3969 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 DNAH2Q9P225 4427 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 RTL8CO15255 209 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 TSPAN13O95857 204 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 LCE6AA0A183 80 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 A0A1W2PPM0 123 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 H7C2G1 150 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 VPREB1P12018 145 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 TNP2Q05952 138 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 GAGE2BQ13066 116 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.42□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 A0A096LNI7 61 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 C16orf90A8MZG2 172 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 NCR3O14931 201 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 Q1RN00 199 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.41□□□□□ -1.86
CCL23-202ENST00000613876 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FAM168BA1KXE4 195 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 M0R378 163 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TRIAP1O43715 76 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FABP2P12104 132 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 PSMB2P49721 201 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 VAMP3Q15836 100 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LINC01620Q4KN68 170 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TMEM126AQ9H061 195 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.4□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 GAGE10A6NGK3 116 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 IGLV6-57P01721 117 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 CHTF8P0CG12 524 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 C22orf24Q9Y442 160 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.39□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 A0A1W2PNN7 141 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 K7EP34 96 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TCL1BO95988 128 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 COX6CP09669 75 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 KRTAP10-2P60368 255 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 UBE2V1Q13404 147 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 C7orf33Q8WU49 177 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LINC00167Q96N53 147 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.38□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 H0YGX0 51 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 PANO1I0J062 215 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 CLEC2BQ92478 149 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 DPH3Q96FX2 82 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 EPM2AB3EWF7 344 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 ATXN8Q156A1 80 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 C6orf99Q4VX62 202 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 A0A087WYN8 130 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 H3BMG7 143 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 M0QXV9 152 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 LST1O00453 97 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 PRYO14603 147 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL23-202ENST00000613876 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms