RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP10-8P60410 259 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 RNF151Q2KHN1 245 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 COX7B2Q8TF08 81 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 C14orf144Q96I85 54 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 PRO1933Q9H354 126 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.76□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 PRSS2P07478 247 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 COX8AP10176 69 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 REG3GQ6UW15 175 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 PCP2Q8IVA1 136 aa6.75□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0U1RQV1 116 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF815PA8K554 130 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 TSTD3H0UI37 97 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 CFAP161Q6P656 301 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 Q8IZM0 81 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.74□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 SPAG11BQ08648 103 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 C15orf56Q8N910 161 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFA1O15239 70 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 DLEU1O43261 78 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-210ENST00000580713 LPAP08519 4548 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 CXCL5P42830 114 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 CKS1BP61024 79 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SFTA2Q6UW10 78 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0J9YXY3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 F8WDY8 70 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 HERV-K104P63124 156 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf82Q6UX34 121 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf48Q96LS8 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 HIGD1BQ9P298 99 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00587B1AMM8 73 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM238C9JI98 176 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SLPIP03973 132 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 DDTP30046 118 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SYCNQ0VAF6 134 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 C10orf25Q5T742 122 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 TIMM17BO60830 172 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM13P0DJ93 91 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 CARD19Q96LW7 228 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 ERG28Q9UKR5 140 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 MUC2Q02817 5179 aa6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-210ENST00000580713 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.65□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0U1RRA0 63 aa6.64□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 PFN2P35080 140 aa6.64□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 B5MCH6 92 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00158P58513 81 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 CTAG1AP78358 180 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 COX17Q14061 63 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 HIST1H4GQ99525 98 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 LITAFQ99732 161 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 HSD52Q0P140 79 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 TAL2Q16559 108 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZRP5 223 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 SPANXCQ9NY87 97 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZVH6 145 aa6.61□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.61□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 DAND5Q8N907 189 aa6.61□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 PRR4Q16378 134 aa6.6□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 IFITM1P13164 125 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 NPC2P61916 151 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 CEND1Q8N111 149 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms