RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 COX7B2Q8TF08 81 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 SPANXCQ9NY87 97 aa8.74□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WZ39 114 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 H3BUT2 72 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 C14orf177Q52M58 125 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.72□□□□□ -1.01
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SPNS3-202ENST00000572078 A0A1W2PPM0 123 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE10A6NGK3 116 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CRPP02741 224 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 REG3AQ06141 175 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 MIAQ16674 131 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.71□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.7□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 PRR34Q9NV39 138 aa8.7□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 K7ERJ3 54 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 COX7A2LO14548 114 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 APOMO95445 188 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 XCL1P47992 114 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0B4J2C4 111 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 A4D1N5 150 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 MALP21145 153 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 C5orf38Q86SI9 138 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 LITAFQ99732 161 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.68□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 K7EP34 96 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 SLPIP03973 132 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CHTF8P0CG12 524 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CFAP161Q6P656 301 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZRU5 148 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CFC1BP0CG36 223 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CFC1P0CG37 223 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CXCL5P42830 114 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 Q8IZM0 81 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 ERG28Q9UKR5 140 aa8.65□□□□□ -1.02
SPNS3-202ENST00000572078 CKS1BP61024 79 aa8.64□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.64□□□□□ -1.03
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SPNS3-202ENST00000572078 A0A087WYN8 130 aa8.63□□□□□ -1.03
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SPNS3-202ENST00000572078 TSPAN13O95857 204 aa8.62□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 Q1RN00 199 aa8.62□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 PSMB2P49721 201 aa8.61□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00158P58513 81 aa8.61□□□□□ -1.03
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SPNS3-202ENST00000572078 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.61□□□□□ -1.03
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SPNS3-202ENST00000572078 NPC2P61916 151 aa8.6□□□□□ -1.03
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SPNS3-202ENST00000572078 COX17Q14061 63 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.59□□□□□ -1.03
SPNS3-202ENST00000572078 DAND5Q8N907 189 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 C15orf56Q8N910 161 aa8.58□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01600Q96MT4 127 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.56□□□□□ -1.04
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SPNS3-202ENST00000572078 H7C2G1 150 aa8.56□□□□□ -1.04
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SPNS3-202ENST00000572078 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.55□□□□□ -1.04
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SPNS3-202ENST00000572078 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 DPH3Q96FX2 82 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.54□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 LPAP08519 4548 aa8.54□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.53□□□□□ -1.04
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 H3BMG7 143 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP10-8P60410 259 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 ATXN8Q156A1 80 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 C2orf82Q6UX34 121 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.52□□□□□ -1.05
SPNS3-202ENST00000572078 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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