RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ENHOQ6UWT2 76 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F8WDY8 70 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GX51 115 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N814 137 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRR34Q9NV39 138 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STAB1Q9NY15 2570 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRAPQ8TCY5 172 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IMUPQ9GZP8 106 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00846Q9NV44 126 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP10-11P60412 298 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZTC4 211 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0J9YWU9 116 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TENM3Q9P273 2699 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANK2Q01484 3957 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAST4O15021 2626 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00167Q96N53 147 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOTCH1P46531 2555 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00575Q6W349 94 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 hADV29S1A0JD25 119 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCKP06307 115 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ESRGQ1W209 222 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UQCRQO14949 82 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV6-57P01721 117 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087WVE0 104 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MUC7Q8TAX7 377 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C4orf26Q17RF5 130 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZQY7 126 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZRU5 148 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6JHZ5 121 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DIRC1Q969H9 104 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BNG1 76 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C15orf56Q8N910 161 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SEC61GP60059 68 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VPREB1P12018 145 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX7BP24311 80 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q5XG85 94 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DPH3Q96FX2 82 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBL5Q9BZL1 73 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COL6A5A8TX70 2615 aa8.21□□□□□ -1.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATOX1O00244 68 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYGAP11844 174 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DSCR8Q96T75 97 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R2N4 97 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZQT0 140 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZRP5 223 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRO0628Q9UI54 55 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R378 163 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX7CP15954 63 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OXTP01178 125 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C2orf48Q96LS8 159 aa8.19□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP17L23D6RBM5 183 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYCNQ0VAF6 134 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM258P61165 79 aa8.16□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HAMPP81172 84 aa8.16□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.16□□□□□ -1.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.15□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.15□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms