RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 SS18Q15532 418 aa4.51□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZRU5 148 aa4.51□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM223A0PJW6 202 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BMG7 143 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 J3QQQ9 107 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 MALP21145 153 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYCNQ0VAF6 134 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZUT4 128 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCX2Q9H322 139 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOMO95445 188 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN13O95857 204 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAGE2BQ13066 116 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRO0461Q9UI25 63 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 COX7A2LO14548 114 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCGB1A1P11684 91 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMB2P49721 201 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 C5orf38Q86SI9 138 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMELXQ99217 191 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.48□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0J9YXV3 536 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM238C9JI98 176 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 ETDBQ3ZM63 59 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIGMAR1Q99720 223 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.47□□□□□ -1.69
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0B4J2C4 111 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFC1BP0CG36 223 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFC1P0CG37 223 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPAG11BQ08648 103 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0J9YXY3 114 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PNN7 141 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 A4D1N5 150 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCL1BO95988 128 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTURNQ8N3F0 131 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERG28Q9UKR5 140 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.45□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0QXV9 152 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFTA2Q6UW10 78 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 REG3GQ6UW15 175 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZRP5 223 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC01600Q96MT4 127 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.44□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q1RN00 199 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEN1Q86WV5 123 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM104AQ969W3 186 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf48Q96LS8 159 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPANXCQ9NY87 97 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM168BA1KXE4 195 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIMM17BO60830 172 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN8Q156A1 80 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf137Q5JT78 98 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf25Q5T742 122 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.42□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 H7C2G1 150 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFA1O15239 70 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A20O43772 301 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS2P07478 247 aa4.41□□□□□ -1.7
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